Tuy nhiên, cũng xuất hiện những tồn tại, bất cập như: Ranh giới các phân khu chức năng chưa phù hợp với yêu cầu phát triển; tình trạng giao đất chồng chéo, tranh chấp đất đai kéo dài với các hộ dân tại các thôn, bản vùng đệm thuộc 2 tỉnh Vĩnh Phúc và Thái Nguyên. Vì vậy, quy hoạch Vườn cần được điều chỉnh để khắc phục những tồn tại nêu trên.
Thực hiện Quyết định số 3802/QĐ-BNN-KH ngày 22/9/2017 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và PTNT Phê duyệt danh mục và giao nhiệm vụ quản lý các dự án điều tra cơ bản và quy hoạch mở mới năm 2018; ngày 20/10/2017 Tổng cục trưởng Tổng cục Lâm nghiệp ký Quyết định phê duyệt đề cương, dự toán “Dự án rà soát, điều chỉnh quy hoạch Vườn quốc gia Tam Đảo”.
Nội dung, trình tự các bước thực hiện Dự án điều chỉnh quy hoạch Vườn quốc gia Tam Đảo theo hướng dẫn tại Thông tư 78/2011/TT-BNNPTNT ngày 11/11/2011 của Bộ Nông nghiệp và PTNT Quy định chi tiết thi hành Nghị định số 117/2010/NĐ-CP ngày 24/12/2010 của Chính phủ về tổ chức và quản lý hệ thống rừng đặc dụng. Thời gian thực hiện dự án 01 năm (năm 2018). Việc triển khai thực hiện điều chỉnh Quy hoạch là cơ sở để Bộ báo cáo Thủ tướng Chính phủ Quyết định điều chỉnh quy mô diện tích, các phân khu chức năng của Vườn quốc gia Tam Đảo trong giai đoạn tới./.